Głęboko pod ziemią, w wiosce o nazwie Giha, kopacze kopią tunele, hodowcy hodują wieprzokrety, a ludzie żyją w wiecznym strachu przed trzęsieniami ziemi. Simon to jeden z kopaczy. Pewnego dnia znajduje kamień, który pulsuje dziwnym światłem oraz tajemniczą, wielką twarz. Dzieli się swoim odkryciem z przyjacielem, Kaminą. Kamina jest przywódcą „Gurren Brygady”. Napędzany własnymi ambicjami oraz wspomnieniami o ojcu pragnie wydostać się na „powierzchnię”, która jest mitem i w powszechnym mniemaniu nie istnieje.
Wkrótce następuje kolejne trzęsienie ziemi, które powoduje zawalenie sufitu podziemnej wioski, po czym do środka wpada ogromny Gunmen, a za nim Yoko. Simon odnajduje znalezioną przez siebie wcześniej „wielką twarz” i wykorzystuje ją do walki. Po wydostaniu się na powierzchnię, bohaterowie wkraczają w nowy etap życia, w którym muszą walczyć o przetrwanie swoje i innych.